Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ROMO1P60602 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
ROMO1P60602 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms