Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFRD-1P60508 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVFRD-1P60508 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms