Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA3P59666 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA3P59666 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA3P59666 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA3P59666 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA3P59666 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms