Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LOXL3P58215 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LOXL3P58215 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms