Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME5P56597 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME5P56597 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME5P56597 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME5P56597 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NME5P56597 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NME5P56597 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME5P56597 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME5P56597 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME5P56597 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME5P56597 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms