Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC4P56524 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC4P56524 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms