Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNB3P54284 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNB3P54284 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNB3P54284 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms