Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARSP54136 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARSP54136 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARSP54136 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARSP54136 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RARSP54136 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RARSP54136 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RARSP54136 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARSP54136 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARSP54136 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARSP54136 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARSP54136 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms