Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGGT1BP53609 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PGGT1BP53609 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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PGGT1BP53609 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PGGT1BP53609 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PGGT1BP53609 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PGGT1BP53609 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PGGT1BP53609 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP53609 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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