Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GBX2P52951 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX2P52951 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX2P52951 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GBX2P52951 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GBX2P52951 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GBX2P52951 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms