Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP98P52948 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP98P52948 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP98P52948 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP98P52948 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms