Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPL12P52815 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPL12P52815 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms