Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2A1P52655 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms