Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK4P51957 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK4P51957 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK4P51957 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK4P51957 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEK4P51957 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEK4P51957 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEK4P51957 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEK4P51957 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEK4P51957 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK4P51957 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK4P51957 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK4P51957 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms