Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AFF1P51825 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFF1P51825 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFF1P51825 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms