Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNA2P51530 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNA2P51530 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNA2P51530 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNA2P51530 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNA2P51530 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNA2P51530 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNA2P51530 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms