Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB2P47870 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB2P47870 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms