Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS9P46781 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS9P46781 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS9P46781 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS9P46781 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS9P46781 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS9P46781 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS9P46781 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS9P46781 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS9P46781 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS9P46781 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms