Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL35P42766 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL35P42766 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPL35P42766 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPL35P42766 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPL35P42766 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPL35P42766 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms