Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3CAP42336 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3CAP42336 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms