Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC1P41238 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOBEC1P41238 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms