Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FDFT1P37268 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms