Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDIT3P35638 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDIT3P35638 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms