Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD13P35453 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD13P35453 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms