Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSG3P32926 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DSG3P32926 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DSG3P32926 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms