Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASQ1P31415 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASQ1P31415 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms