Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CLIP1P30622 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CLIP1P30622 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CLIP1P30622 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms