Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSPOP30536 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSPOP30536 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TSPOP30536 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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