Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCND3P30281 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCND3P30281 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCND3P30281 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCND3P30281 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCND3P30281 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCND3P30281 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCND3P30281 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCND3P30281 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCND3P30281 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCND3P30281 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCND3P30281 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms