Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP5DP30049 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5DP30049 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms