Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALDH4A1P30038 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms