Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL4A5P29400 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A5P29400 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
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