Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUSP1P28562 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms