Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITGA3P26006 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA3P26006 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms