Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMA3P25788 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA3P25788 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms