Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGS1P23219 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGS1P23219 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms