Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTNP21246 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTNP21246 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTNP21246 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTNP21246 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms