Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP4AP20648 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP4AP20648 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms