Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB4AP20338 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB4AP20338 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms