Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATF3P18847 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATF3P18847 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ATF3P18847 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF3P18847 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF3P18847 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF3P18847 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF3P18847 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF3P18847 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms