Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF1P18846 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF1P18846 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF1P18846 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF1P18846 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF1P18846 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF1P18846 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF1P18846 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF1P18846 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF1P18846 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms