Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2A2P16615 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A2P16615 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms