Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB3P16520 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB3P16520 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB3P16520 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB3P16520 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB3P16520 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB3P16520 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB3P16520 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms