Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPCAMP16422 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms