Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTLA4P16410 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms