Protein–RNA interactions for Protein: P15813

CD1D, Antigen-presenting glycoprotein CD1d, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1DP15813 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD1DP15813 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD1DP15813 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD1DP15813 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD1DP15813 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD1DP15813 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD1DP15813 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD1DP15813 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD1DP15813 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms