Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXB3P14651 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB3P14651 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms