Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DMDP11532 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DMDP11532 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DMDP11532 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DMDP11532 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DMDP11532 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DMDP11532 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DMDP11532 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DMDP11532 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DMDP11532 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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