Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2AP11388 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOP2AP11388 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2AP11388 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms