Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM225BP0DP42 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM225BP0DP42 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms